Деятельность кафедры информационной безопасности компьютерных систем и Специализированного центра защиты информации ГОУ «СПбГПУ» включает не только подготовку кадров в области защиты компьютерной информации, но и разнообразную научно-исследовательскую деятельность в области проектирования, создания и сертификации средств обеспечения информационной безопасности компьютерных систем.
Работы, связанные с решением проблем информационной безопасности, проводятся на кафедре ИБКС с 1992 года. Богатый опыт кафедры, сформировавшаяся концепция подготовки специалистов по защите компьютерной информации и сложившаяся система основных принципиальных положений, образующих важное направление создания теоретических основ построения защищённых систем обработки информации, позволяют говорить о создании научной школы в области обеспечения информационной безопасности, которая занимает лидирующее положение среди российских вузов и научных организаций.

Основные направления научных исследований в СЦЗИ в области критических технологий включает:
- Теория и методология обеспечения информационной безопасности и защиты информации. Принципы и решения (технические, математические и др.) по созданию новых и совершенствованию существующих средств защиты информации, различных объектов, включая распределенные системы, мобильные системы, сеть Internet. Обеспечение информационной безопасности на основе защищенных операционных систем. Модели, методы и средства обеспечения внутреннего и удаленного аудита и мониторинга состояния объекта, находящегося под воздействием угроз нарушения его информационной безопасности.
- Модели и методы управления информационной безопасностью.
- Модели и методы оценки защищенности информации и информационной безопасности объекта, эффективности систем и комплексов обеспечения информационной безопасности.
- Криптографические методы обеспечения информационной безопасности, методы криптоанализа.
Производственная деятельность СЦЗИ направлена на разработку и сертификацию актуальных средств обеспечения информационной безопасности.
Анализ состава и структуры продуктов обеспечения информационной безопасности с учетом современных тенденций приведен на следующем рисунке: